Die erste Episoder der siebten und finalen Staffel von „Agents of S.H.I.E.L.D.“ führte einen neuen Hydra-Twist ein, der das widerspiegelt, was in „The Return of the First Avenger“ enthüllt wurde. Mack und sein Team nutzen Zeitreisen, um die Geschichte des Marvel Cinematic Universe zu erforschen, nachdem sie in früheren Staffeln schon mit dem Thema Zeitreise gespielt hatten. Aber jetzt sind sie in einer Art Zeitkrieg mit einer außerirdischen Rasse gefangen, die als Chronicoms bekannt ist und die versuchen, die Geschichte neu zu schreiben, um sicherzustellen, dass die Erde in der Gegenwart wehrlos ist. Zu diesem Zweck haben sie Wilfred Malick ins Visier genommen, dessen Sohn Gideon einer der wichtigsten Führer von Hydra werden soll. Die Chronicoms glauben, dass die Zerstörung von Hydra die Gründung von S.H.I.E.L.D. verhindern wird, was die Ereignisse von „The Return of the First Avenger“ komplett verändern würde.
In diesem Film behauptete Arnim Zola, dass Hydra als Folge der „Operation Paperclip“ S.H.I.E.L.D. unterwandert habe, ein umstrittenes, real existierendes Projekt der US-Regierung, das deutsche Spitzenwissenschaftler ins Land importierte. „Nach dem Krieg wurde S.H.I.E.L.D. gegründet und ich wurde rekrutiert“, erklärte Zola. „Das neue Hydra wuchs. Ein schöner Parasit im Inneren von S.H.I.E.L.D. “ Laut der neuen Episode unterschätzte Zola jedoch das Ganze: Tatsächlich war die Gründung von S.H.I.E.L.D. selbst Teil einer verdeckten Hydra-Strategie. Obwohl dies ein Retcon ist, ist es kaum ein Kontinuitätsproblem. Selbst in den Comics hat Hydra ihre Führung abgeschottet, was bedeutet, dass kein einziger Führer alle Informationen hatte. Es gibt keinen Grund anzunehmen, dass die MCU-Version von Hydra anders war oder ist.
Dies passt zur 2. Staffel von „Agent Carter“, in der Peggy Carter eine Verschwörung namens „Rat der Neun“ aufdeckte. Diese Gruppe von Geschäftsleuten und Politikern strebte die Weltherrschaft an, und sie strebten nach politischer Macht durch Attentatspläne und fortschrittliche Technologie. Obwohl Marvel den Rat der Neun nie offiziell an Hydra gebunden hatte, gab es starke Hinweise, da ihre Insignien den historischen Hydra-Logos ähnelten, die in der 3. Stafel von „Agents of S.H.I.E.L.D.“ entdeckt wurden. Der Rat der Neun – oder eine ähnliche Hydra-Fraktion – könnte durchaus die Gründung von S.H.I.E.L.D. orchestriert haben. Wilfred Malick mag 1931 während der Weltwirtschaftskrise ein Niemand gewesen sein, aber vermutlich änderte sich sein Schicksal in den 1940er Jahren, was ihn zu einer Schlüsselfigur dieser Zeit machte…
Zola mag nicht korrekt gewesen sein, als er die Geschichte von S.H.I.E.L.D. und Hydra erzählte, aber er hatte wahrscheinlich Recht, als er den Grund für die Verwendung von S.H.I.E.L.D. beschrieb. „Hydra wurde auf dem Glauben gegründet, dass man der Menschheit ihre eigene Freiheit nicht anvertrauen konnte“, erklärte er. „Was wir nicht erkannten, war, dass sie Widerstand leisten, wenn man versucht, sich diese Freiheit zu nehmen. Der Krieg hat uns viel gelehrt. Die Menschheit musste ihre Freiheit freiwillig aufgeben.“ Zu diesem Zweck nährte Hydra insgeheim jede Krise, jeden Krieg und jeden Akt des Völkermords und führte die Menschheit zu dem Punkt, an dem sie diese kostbare Freiheit an S.H.I.E.L.D. abgeben würde. Zum Glück für die Welt hatten sie nicht mit Captain America gerechnet…
Es gibt eine Comic-Vorlage für die Idee, dass Hydra S.H.I.E.L.D. geschaffen hat. Im Jahr 2009 startete Jonathan Hickman seine Serie „Secret Warriors“, die eine wichtige Inspiration für die Serie darstellte. Dabei erkannte Nick Fury, dass S.H.I.E.L.D. von Anfang an kompromittiert war, von Hydra gegründet wurde und in all den Jahren unwissentlich als ihr wichtigster Geheimdienst-Agent gedient hatte. In den Comics entdeckte Fury mit dieser Enthüllung, dass Hydra größer war, als er jemals geglaubt hatte, und in „Agents of S.H.I.E.L.D.“ und im MCU könnte es durchaus dazu dienen, Hydra wieder zu einer aktuellen Bedrohung zu machen!